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UltraEdit软件查看GenBank全基因组序列

发布时间:2023-12-08 09:51:47人气:267


  

UltraEdit  

试验查找数据中发现,很多人都是每次登录NCBI网页查找自己要找的基因序列或者病毒/细菌等的全基因组序列,聪明的孩子都是在网页上使用“Ctrl+F”进行搜索,可爱的孩子就是滚动鼠标慢慢地寻找。  

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然而,每次都要打开全基因组,有的浏览器和网络并不会直接的显示全基因组,而是需要手动按照下列顺序点击更新出序列,太费时。  

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而下载genbank文件(文件后缀.gb)后,很多软件可以打开,如GenomeComplier、GenomeComplier和UltraEdit等等软件。  

GenomeComplier  

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UltraEdit  

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跟大家介绍一下UltraEdit,十分简单,NCBI下载全基因组序列文件.gb后,使用打开UltraEdit文件,结合“Ctrl+F”快速搜索即可,怎么说呢,经常需要查阅的病毒或者细菌全基因的各种基因时,比如转录组结果和蛋白组结果时。 

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其实使用txt文本也能打开,将文件后缀改成“.txt”即可,打开时就是与NCBI一致,包含了全部的文字信息。  

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不是什么特别的软件,只是为了方便不再一遍遍的打开NCBI,懂得都懂,那速度有时候就是进不去。



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