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GraphPad Prism作图教程

发布时间:2023-12-29 10:40:46人气:314

GraphPad Prism不能说是所有科研人画图必备,也得说是每一个科研人画图必备!


本系列笔记分两部分。第一部分是本篇,主要介绍GraphPad Prism7如何制作常用的文献图,解决怎么做图的问题。现在已经升级到10版本了,不过换汤不换药,主要功能变化不大。第二部分是介绍常用的统计分析方法,解决做什么图的问题。笔记来自某大型平台的教程,ppt也做得很棒。


使用这个软件也一样,在使用过程中发现柱子间距太小,或需要用到不连续坐标轴等等问题时,带着问题再来这里寻求答案是更快捷的方法。

一、主要功能与界面介绍

 1. 数据表格界面与Excel相似,可将数据录入后保存。

数据表格界面.png

 2. 数据图类型

       通过下面图例,可一目了然地看出各图在什么情况下使用。

(1)XY图:适合于连续变化的数据。

(2)Column(单维度分组图):适合于一种因素的分组数据。

(3)Grouped(二维度分组图):适合于双向变量的分组数据,即每一列定义一个组别,每一行也定义一个组别。

(4)Contingency(列联表):临床应用较多,此文略。

(5)Survival(生存曲线):表示生存曲线。

(6)Parts of whole(整体比例):展现各部分数据占比。

数据图分类.png

二、折线图绘制方法


 1. 选择作图类型

折线图.png

 2. 输入数据(3次重复)

输入数据.png

 3. 选择样式

折线xy.png

 4. 修改图例、标题、作图区、坐标轴(哪里要改点哪里,单击或双击,玩一玩就会啦)、整体字体

(1)作图区格式修改

作图区格式修改.png

(2)坐标轴整体修改

坐标轴整体修改.png

(3)坐标轴独立格式修改

坐标轴独立格式修改.png

(4)坐标轴标题字体格式修改

坐标轴标题字体格式修改.png

(5)整体文字格式修改

整体文字格式修改.png

三、单维度分组图

       只有一种因素的分组。

       由于图表格式设置等和前面相似,后面只展示不同的处理部分。

(一)柱形图

   1. 选择作图类型(Column)

选择作图类型.png

   2. 输入数据,选择样式

输入数据,选择样式.png

   3. 修改坐标轴标题、坐标轴、作图区等

   4. 对柱子间距、宽度、Y轴刻度方向等进行调整

对柱子间距、宽度、Y轴刻度方向等进行调整.png

   5. 设置Y坐标轴标题和标签距离坐标轴线的距离

设置坐标.png

   6. 不连续坐标轴设置

不连续坐标轴设置.png

(二)散点图

   1. 选择作图类型(Column)

   2. 输入数据,选择散点图


   3. 修改坐标轴标题,双击作图区空白位置设置散点图格式


   4. 修改X轴,将标签的倾斜度改为水平


四、二维度分组柱形图

       适合于二重分组的数据,即数据分组具有双向变量,每一列定义一个组别,每一行也定义一个组别。

 1. 选择作图类型(Group)


 2. 输入数据,选择样式

 3. 修改坐标轴标题和字体

 4. 修改图形格式

 5. 设置柱子粗细、刻度方向等

* 3-5方法同前。

 6. 若设置叠加图,可进行如下操作:

设置叠加图步骤.png

四、生存曲线图

       随访时间、在随访时间上的生存状态及影响因子(如基因表达)是必要因素。生存曲线不仅可以用于比较生存率,还可用于其他结局事件是二分类变量的分析,如是否复发,是否转移等。

 1. 研究因素分组:可利用MEDIAN函数(中位数函数)、IF函数(条件函数)计算出表达列的中位数,将数据分为高表达和低表达组(低于中位数为低表达组,其余为高表达组)。

 2. 替换数据:在Excel中将Alive替换成0,Dead替换成1。


 3. 选择生存曲线(Survival),X为随访时间,Group A为低表达组,Group B为高表达组。Excel中将低表达、高表达数据分别筛选出来复制到Prism数据表。

4. 选择样式,修改标题


 5. 修改作图、字体等

 6. 如需要选择全框,双击坐标轴,点击Frame and Origin→Frame style中调整。


五、热图

       7.0版本新增功能。热图利用不同颜色反应数值大小,直观反映数值差异。


 1. 新建数据表(Group),数据独立无重复,选择第一个选项。


2. 输入数据,选择样式(Heat Map,第四个色系最常用)


 3. 修改标签:将原始的横纵轴标签改为行、列标签,行标签位置居于顶部。


 4. 调宽格子:Graph Settings→Shape and size→Width调大。也可以拖动作图区长度。


5. 色条属性设置:双击色条属性框→Color mapping→Range设置色条范围。最小值设置为比数据最小值小的整数,最大值设置为比数据最大值大的整数

       色条水平放置:Legend→Orientation,选择水平

       色条标签:Legend→Scale,设置色条标签间隔及起始值


 6. 拖动色条边角,设置色条大小及位置

 7. 设置字体



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