SnapGene软件将DNA序列转换为氨基酸序列

发布时间：2024-02-18 15:42:49人气：1408

本文分为两部分：SnapGene软件概览；如何使用SnapGene将DNA序列转换为氨基酸序列；

SnapGene软件概览

1.打开SnapGene软件，可以看到欢迎界面；

2.选择一个选项就可以进入到软件的界面；

3.这里，我们先打开一个已有的文件继续操作；

4.进入软件界面后，我们可以看到顶部的菜单和工具栏；

5.以及侧面的工具栏；

6.还有底部的选项卡菜单，可以预览不同的形式；

7.侧面的这两个工具栏提供了对常见文件操作和显示的快速访问：

8.底部的选项卡在注释中显示序列的备用视图；

9.和其他软件一样，SnapGene顶部的【File】“文件”菜单有创建、打开和保存文件的选项；

10.SnapGene顶部的工具栏里也包含了常用的功能；

11.在顶部的【Edit】“编辑”菜单中，包括了针对核酸（nucleic acids）和蛋白质（proteins）进行优化的常用编辑工具：

12.【View】“视图”菜单里有全部的查看和交互选项，允许用户在序列的不同视图之间切换、隐藏或显示工具栏。也可以从这里更改字体大小，或者打开和关闭注释。

注：SnapGene软件概览部分图片来源于网络

如何使用SnapGene将DNA序列转换为氨基酸序列

在序列比对的过程中，常常需要将核苷酸序列转换为氨基酸序列，比对氨基酸是否有所突变。方法有很多，我常用的一种是通过SnapGene软件转换。操作如下：

1.需要准备一条目的基因序列（fasta格式），通过SnapGene软件打开。点击Map选项卡，选中CDS的区域（如果这个文件为cds序列，则全部选中；若cds是片段，则选中cds的片段部分）

界面.png

进入页面

2.点击上方feature-Add feature，给CDS区域加上feature；

3.设置feature，点击Type-CDS-OK，设置完毕；

4.点击Action-Make protein，得到氨基酸序列；

5.点击Sequence即是需要氨基酸的序列，可以保存为prot文件，也可以复制保存为fasta格式文件。