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常见问题

ChemDraw几个实用工具

发布时间:2022-11-09 11:43:44人气:1046

  ChemDraw作为使用最为广泛的化学结构绘制工具,为科学家提供了套完整易用的绘图解决方案,成为化学和生物学家的必备使用工具。ChemDraw使用中重要的是掌握它的使用方法和技巧,并熟练的运用它为自己的工作、学习服务。本文将对ChemDraw的使用方法做一个简要的介绍,并为大家展示若干复杂分子的绘制实例。

  1.主界面


  ChemDraw几个实用工具.png


  其中,主工具栏(MainToolbar)包含了最常用的化学键、选择等绘图工具,主工具栏上的一些图标右下角有一个小黑三角,按住这些图标即可看到其中包含的次级工具栏。


  ChemDraw几个实用工具.png


  生物绘图工具栏(BioDrawToolbar)包含了添加生物和生物化学元素的绘图工具;菜单栏(MenuBar)包含了“文件”、“编辑”、“查看”等各项常用菜单,这些菜单的具体内容这里这里就不做详细介绍了;状态栏(StatusBar)展示当前的状态,如将鼠标置于工具栏某一绘图工具上,则状态栏中将会显示该绘图工具的功能说明;SciFinder工具(SciFinderTool)可以将绘制好的分子直接放到SciFinder中进行检索;放大率控制(MagnificationControls)和文本格式工具(TextFormattingTools)分别用来调整放大率和文本的字体、字号;文档视窗(DocumentWindow),即中间的空白区域,就是我们将要在上面绘制各种分子的地方。


  2样式调整


  向一些期刊投稿时,文章通常被规定了一定的格式,其中包括了特定的比例、字体、页面大小,等等。而ChemDraw则具有一个基于许多著名科学出版物的文档设置库,如果你计划提交文件到一个特定的杂志,只需要打开样式表,选择相应的期刊,即可调整为该期刊所规定的样式。例如,要选择样式“ACSDocument1996”进行绘制,其操作为:File→OpenStyleSheets→ACSDocument1996。

      ChemDraw几个实用工具.png


  若要调整已绘制好的文档的样式,则其操作为:File→ApplyDocumentSettingsfrom→ACSDocument1996;若要调整已绘制好的某个分子的样式,则其操作为:选定要调整的分子→Object→ApplyObjectSettingsfrom→ACSDocument1996。当然,除了这些期刊规定的样式外,你也可以按如下步骤创建你自己的样式表:


  1.创建一个新文档;


  2.在File→DocumentSettings中进行页面大小,字体,颜色,键的长度、粗细、角度等各项设置,例如,在下图所示的对话框中可以调整页面大小;

       ChemDraw几个实用工具.png


  点击“SaveAs”,在对话框中选择ChemDrawStyleSheet文件格式,命名并保存。


  5.png


  3快捷键


  在ChemDraw中,使用快捷键可以方便快捷的添加各种原子、键型、官能团等,亦可便捷的使用其他各项功能,熟练运用这些快捷键,能让我们的绘图过程更加高效。


  1.将鼠标置于原子上,使用快捷键,可以直接添加原子或官能团:

      ChemDraw原子快捷键.png

  

  2.将鼠标置于化学键上,使用快捷键,可以直接修改键型:

       ChemDraw快捷键.png

  

  3.其他快捷功能:


  ChemDraw快捷键.png


  4绘图实例


  在介绍了ChemDraw的基本使用方法后,下面将展示两个绘图实例,通过实例,大家将能够更好的理解ChemDraw的各种工具及快捷键的使用。


  实例一:具有多中心连接位点的金属有机化合物,如二茂铁:


  1.先用模板画出一个茂环;


  用模板画出一个茂环.png


  2.选中这个茂环,然后点击Structure→AddMulti-CenterAttachment,这时茂环中心出现一个星


  选中茂环.png


  3.从星环引出一个单键,把单键的另一端定义为Fe,再从Fe引出另一个单键;


  单键界面.png


  4.用同样的方法画出另一个茂环并为其添加中心;


  画出另一个茂环.png


  5.按住Shift键,分别单击从Fe引出的单键的末端和茂环的中心,然后使用Join功能(Ctrl+J),连接选定的两个位点,交叉式二茂铁分子就完成了。


  Join功能.png


  实例二:具有复杂结构的有机化合物,以海葵毒素为例:


  1.先直接画出左上角的片段,其中的五、六、七元环都可以直接用工具栏中的模板绘制;


  模板绘制.png


  2.使用工具栏中的“SnakingChain”工具画出一段碳链,该工具可以保持120°的键角画出任意形状的碳链


  “SnakingChain”工具画出一段碳链.png

       “SnakingChain”工具画出一段碳链界面.png


  3.为这段碳链加上官能团的修饰,使用快捷键能使添加官能团更加方便,如将鼠标置于待添加处按O即可添加氧或羟基;


  4.使用“AcyclicChain”工具画出下一段碳链,与“SnakingChain”不同的是,该工具只能画出波浪形的碳链;


  “AcyclicChain”工具画出下一段碳链.png


  5.修饰碳链;


  6.重复以上过程,完成分子的基本结构;


  ChemDraw几个实用工具.png


  7.添加楔形键,其中,添加实楔形键的快捷键为w,添加虚楔形键的快捷键为h。至此,海葵毒素的分子结构已全部绘制完成。通过这两个绘图实例的展示,我们可以直观的看到灵活运用ChemDraw的各种绘图工具及快捷键为绘图过程带来的便利。


  ChemDraw几个实用工具.png



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