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常见问题

化学绘图软件ChemDraw真的什么都能干

发布时间:2023-02-14 11:47:12人气:3856

化学绘图软件——ChemDraw,绘制平面化学结构、生成立体化学模型、查询化学信息、编写化学脚本、计算化学数据等等,堪称化学界的必备神器。

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1、绘制平面化学结构

通过使用ChemDraw可以绘制基本化学结构,基本化学结构包括固定长度的键、固定角度的键、楔键、碳氢长链、双键。在字形子菜单中包括三种常见字的操作:Superscript(上标)、Subscript(下标)、Formula(字形,数字自动缩小)。使用ChemDraw 15.1 Pro可以绘制的化学结构式包括无机结构式、有机结构式、反应物、产物、箭头、反应条件、分子下方文本框、阴影框等。

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ChemDraw绘制青霉素分子结构式

2、生成立体模型

最新版Chem 3D集成ChemDraw和Chem 3D,可简化2D和3D模式之间的结构互换,使合成化学和计算数据之间的交流更有效和开放,通过Chem 3D中的ChemDraw Panel面板模板还可以创建三维结构。化学学生可以使用Chem 3D组件加深入地认识分子的3D空间结构及对其属性所产生的影响。Chem 3D提供3D分子模拟图形,化学学生可通过研究化合物的三维结构来预测化合物属性和特异性,Chem 3D中有五种类型的模型显示形式。

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3、自动生成能量驱动图

利用Chem3D软件可以计算任意立体结构二面角的能量并自动生成能量驱动图,主要步骤是先在Chem3D软件窗口绘制完成自己需要的立体结构,然后使用选择工具选中需要计算能量的二面角,如果无法使用选择工具一次性选中,安装Shift键依次单击即可。最后点击Calculations计算菜单并选择Dihedral Driver命令下面的Single Angle Plot(单角)或者Double Angle Plot(双角),此时绘制窗口的立体结构会围绕已选中二面角进行旋转,同时在Output窗口中生成一系列能量数据。当旋转驱动结束,Chem3D软件 窗口会自动弹出Dihedral Driver Chart(二面角能量驱动图),单角的能量驱动图如下所示。

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4、计算化学数据

ChemDraw和Chem 3D均可进行化学数据计算工作,主要有以下几项,利用软件系统内嵌的基于分子力学的MM2方法,可对分子构型进行动力学模拟,利用内嵌的GAMESS量子化学软件包,可对分子构型进行优化,除此之外还可以计算IR、Raman和NMR、核磁共振图谱等数据。


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5、查询化学信息

ChemFinder是ChemDraw化学软件中的数据库管理系统,不仅可以进行化学物质的理化数据查询还可以自己建立ChemFinder数据库。包含的多种化学通用数据库共四十多万个化合物的性质、结构、反应式、文献等检索条目的分析和利用,可为化学家的目标化合物设计、反应路线选择和物化性质预 测以及文献的调用提供极大的方便。ChemFinder不仅能查找该分子结构的ACX编号,而且还能够查找相关合成路线以及参考文献来了解该化合物的一些 基本的理化性质,灵活使用ChemFinder在线检索功能,不仅在化学教学上有较大帮助,而且对化学相关的科研工作也大有裨益。

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6.绘制K.C.Nicolaou教授报告中那般绚丽多彩的分子结构

步骤:1) 选中目标分子,点击打开general tools中的pentools选项如图。

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2) 如图打开Crvues选项条选择filled

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3) 用鼠标选中要filled的结构的每一点。

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 4) 选中图层填充改变颜色。

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5) 将分子至于图层的前段就可以得到最终效果。

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也可以实现分子的不同颜色

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如图打开Crvues选项条选择shaded选项可以实现以下效果。

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以上就是ChemDraw提供的主要功能介绍


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