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SnapGene 的介绍

发布时间：2023-03-30 15:52:45人气：3258

SnapGene该软件功能强大，有报道称‘分子生物学界的瑞士军刀’，足可见其重要的作用及价值，包含了序列编辑和标记、质粒图谱构建、酶切位点分析、序列比对等多种功能，是分子克隆常用的软件之一。

第一部分: 操作页面的简单介绍

可以显示质粒图谱上的酶切位点。

可以显示质粒上元件的名称，并利用不同的颜色标注。

可以显示序列对应的氨基酸序列，质粒图谱的开放阅读框及转录方向。同时，还可查看相应ORF的片段大小、GC%值等相关信息。

可以显示蛋白质序列。

可以显示整个质粒的全部碱基序列。

可以使质粒呈线性显示，方便阅读，操作等。

第二部分:质粒图谱

以克隆质粒pUC57 L0为例，首先我们从NCBI中找到其FASTA文件。然后复制其序列。

利用SnapeGene中New DNA File打开所复制的序列。

最终，我们将得到pUC57 L0的质粒图谱（如下）。该图谱上彩色部分，如：ORI(复制的起点), Lac promoter（启动子区域）, AmpR（抗性基因）；上述具体的作用及功能前文已有详细介绍，可参考学习。

此外，若习惯于线性的方式来查看相应的序列，相应的位点，也是可以满足的。

我们还可以根据Addgene获得一些质粒的图谱，来进行模拟操作。

第三部分:质粒图谱的编辑

利用SnapGene上质粒图谱，我们可双击图谱上的相应模块，对相关内容进行修改或调整（基于构建质粒的需要）。可以做到编辑序列名称、方向、范围以及颜色标注等信息。

或者，我们可以基于Sequence进行查看该质粒的序列，并对质粒上相应的元件进行编辑。

第四部分:引物设计

SnapGene可以满足直接在序列上添加引物，选中一段序列后，软件会直接给出序列长度和Tm值，可以据此调整引物序列，获得想要的序列。点击工具栏中的【Primers】—【Add primers】，进入引物编辑界面，可设计正向或者反向引物。

第五部分:酶切位点

该软件可看到酶切位点，并根据酶切位点，结合质粒图谱可以选择合适的克隆方式获得自己所想得到的质粒。

此外，SnapGene功能强大，还可以做序列的比对，克隆过程的模拟，模拟电泳等。本期暂讲述这些内容，后续其功能作用还会继续同大家分享。

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