具体步骤
1.打开SnapGene软件,将txt文件拖入软件起始界面。SnapGene将自动识别txt中的每条序列,并将它们拆分成为单独的序列文件,点击“Import”,SnapGene将生成一个文件夹,文件夹中含有txt中的每一个FASTA序列。保存位置看默认设置。
2. 打开任意一个序列,按快捷键Ctrl+L(=菜单栏Tools-Align to Reference Sequences-Align Imported Sequence...),在弹出的窗口中,将剩下几个序列都选中,点击“打开”。依次查看Map、Sequence标签页。
![1681183147112179.png](/static/upload/image/20230411/1681183147112179.png)
![1681183147107615.png](/static/upload/image/20230411/1681183147107615.png)
![1681183147204296.png](/static/upload/image/20230411/1681183147204296.png)
![1681183147185801.png](/static/upload/image/20230411/1681183147185801.png)
![1681183147828286.png](/static/upload/image/20230411/1681183147828286.png)
![1681183147156930.png](/static/upload/image/20230411/1681183147156930.png)
![1681183147193687.png](/static/upload/image/20230411/1681183147193687.png)
![1681183147100532.png](/static/upload/image/20230411/1681183147100532.png)
![1681183147656183.png](/static/upload/image/20230411/1681183147656183.png)
![1681183148157793.png](/static/upload/image/20230411/1681183148157793.png)
备注:如果序列差别太大也可能匹配不上。
以下介绍质粒或DNA产物测序结果分析方法
![1681183235793823.png](/static/upload/image/20230411/1681183235793823.png)
![1681183235673866.png](/static/upload/image/20230411/1681183235673866.png)
一代测序结果每个样品会有两个文件,即Applied Biosystems Sequence Trace (.ab1)和DNAssist DNA两个文件。前者有序列&峰图信息,后者只有序列信息。我们从文件大小也可以区分哪一个含的信息量更大。一般我会用大的文件进行分析,方便看峰图,因为峰图代表测序结果的质量。
![1681183301828060.png](/static/upload/image/20230411/1681183301828060.png)
![1681183301134532.png](/static/upload/image/20230411/1681183301134532.png)
这一步有三种方法,直接按 Ctrl+L 最简单。
![1681183403534982.png](/static/upload/image/20230411/1681183403534982.png)
![1681183403101919.png](/static/upload/image/20230411/1681183403101919.png)
![1681183403616458.png](/static/upload/image/20230411/1681183403616458.png)
![1681183403693719.png](/static/upload/image/20230411/1681183403693719.png)
![1681183403334200.png](/static/upload/image/20230411/1681183403334200.png)
![1681183404166013.png](/static/upload/image/20230411/1681183404166013.png)
仅适用于测序结果不好的情况。
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