用SnapGene软件进行多序列比对、同源性分析、测序数据分析

具体步骤

1.打开SnapGene软件，将txt文件拖入软件起始界面。SnapGene将自动识别txt中的每条序列，并将它们拆分成为单独的序列文件，点击“Import”，SnapGene将生成一个文件夹，文件夹中含有txt中的每一个FASTA序列。保存位置看默认设置。

2. 打开任意一个序列，按快捷键Ctrl+L（=菜单栏Tools-Align to Reference Sequences-Align Imported Sequence...)，在弹出的窗口中，将剩下几个序列都选中，点击“打开”。依次查看Map、Sequence标签页。

备注：如果序列差别太大也可能匹配不上。

以下介绍质粒或DNA产物测序结果分析方法

一代测序结果每个样品会有两个文件，即Applied Biosystems Sequence Trace (.ab1)和DNAssist DNA两个文件。前者有序列&峰图信息，后者只有序列信息。我们从文件大小也可以区分哪一个含的信息量更大。一般我会用大的文件进行分析，方便看峰图，因为峰图代表测序结果的质量。

这一步有三种方法，直接按 Ctrl+L 最简单。

仅适用于测序结果不好的情况。

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