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SnapGene 7.1.0更新内容

发布时间:2023-12-27 10:25:53人气:226


  

SnapGene7.1为在所选文件夹内简化文件搜索提供了增强功能,为包括引物在内的ssDNA序列引入了二级结构可视化,并包括各种修复以提高稳定性,文件导入工作流和其他功能。  

文件搜索增强  

快速,轻松地建立搜索查询,找到您的序列和其他文件在选定的项目文件夹与简化的过滤器输入控件,并在不同的选项卡中运行多个搜索。  

文件搜索功能.png

单链DNA序列的二级结构视图  

通过新的二级结构选项卡,可视化使用ViennaRNA包计算的单链DNA序列的二级结构。

单链DNA序列的二级结构视图.png  

查看引物发夹和二级结构  

检查你的引物的发夹或其他自结合二级结构与计算引物单体二级结构的新按钮,可在引物标签。  

查看引物发夹和二级结构.png

功能和增强  

增强的文件搜索输入过滤器,以简化和简化构建搜索查询  

搜索条件的简单输入字段自动添加搜索键  

日期和文件类型字段提供了一个快速选择的下拉菜单  

在调整结果选项卡中的查询时,会自动进行搜索  

文件搜索结果增强  

搜索结果现在显示在一个新的选项卡中,允许您重新访问先前的搜索结果  

增强了搜索结果中活动搜索过滤器的可见性和排列  

增加了单链DNA序列的二级结构标签。二级结构的计算使用ViennaRNA包  

在引物视图中增加了“显示结构”按钮,可以查看引物的二级结构  

使用ViennaRNA包计算的结构  

在预测二级结构时,引物结合位点熔化温度被用作默认温度  

添加了一个新的首选项来指定缺少FASTA注释行(在第一个序列之前以“>”开头的行)的文件是作为FASTA序列文件被识别和导入,还是作为文本导入  

现在可以使用⌘+W(macOS)/Ctrl+W(Windows/Linux)键盘快捷键在查看“开始”空间时关闭窗口  

修复了“克隆”教程和“用户指南”在GetStarted部分的扩展和崩溃状态  

其他变更和修复  

在GenBank导入和导出时调整了KEYWORDS的处理  

在导入GenBank文件时,不再使用KEYWORDS作为自定义图标签  

现在可以使用注释导出自定义图标签  

当导入多序列GenBank文件时,对齐对话框不再使用自定义图标签作为序列名称  

调整了向GenBank输出带有片段的特征  

非间隙特征段现在使用join(…)限定符导出到GenBank文件中,包括重叠段和相邻段  

修正了在导出和重新导入GenBank时,核糖体滑动(重叠片段)特征的翻译会发生变化的问题  

添加/ribosomal_slippage限定符到任何有重叠片段的翻译特征  

将“关闭所有选项卡”和“关闭已保存选项卡”选项移动到选项卡操作菜单的顶部,以确保它们易于访问  

调整首选项的措辞,默认情况下将文件作为独立窗口打开  

改进了“集合”左面板中文件夹的颜色,使所选文件夹名称更易于阅读  

在“文件”菜单中增加了“关闭所有选项卡”选项  

将“文件”菜单中的“关闭所有”选项重命名为“关闭所有窗口”  

将“文件”菜单中的“关闭”选项视情况重命名为“关闭窗口”或“关闭选项卡”  

更新链接到SnapGeneAcademy  

改进搜索过滤芯片外观,提高对比度  

在没有提供特征颜色信息的情况下,通过使用特征类型的默认颜色来打开GenBank文件,提高了性能  

改进了在克隆和PCR对话框中输入引物名称或选择引物时的处理  

在Windows上修复了查找酶/功能/引物快捷键(Ctrl+Shift+F)  

修正了与参考DNA序列对齐的问题,即低质量读取导致其他读取不正确对齐  

修复了Bug,在导致额外的碱基被删除从序列读取修剪时,对准参考DNA序列  

修正了SwissProt导入器正确读取蛋白质序列名称的问题  

在从多序列存档文件导入时,正确保留对齐的序列名称  

修复了在一些循环序列上显示GC颜色的问题  

防止在“新建文件”窗格中更改序列名称时自动重新检查传输特性复选框  

修复了当序列有未保存的甲基化变化时将序列转换为圆形/线性的问题  

修复了导致某些文件使用文本查看器打开而不是导入的错误  

修复了当打开“打开此集合”时,集合会在内容窗口中打开的错误.clxn”文件  

导入包含多个序列的文件时,创建并打开一个新项目,而不是一个集合  

修正了在使用网关克隆对话框时出现的各种错误警告  

修复了在Linux上搜索包含某些非序列文件类型的项目的各种问题  

修正了在编辑时转换为双链的序列会恢复为单链的错误,反之亦然  

修复了当文档被替换时,非粘性标签没有被标记为“已修改”的错误  

删除了在非粘性选项卡中查看文件时更新旧文档的提示  

修复了在SnapGene未使用的Windows上无法卸载外部卷的问题  

当压缩超过2GB的数据时,提高了稳定性和性能  

修正了当使用关闭所有窗口并打开多个选项卡时可能发生的崩溃  

改进了稳定性和性能,并解决了各种内存泄漏问题  

增加了可选的匿名使用报告,以支持正在进行的开发和用户研究。请注意,您处理的个人信息和数据内容不会被共享  

如果检查了设置,请确保在新窗口中打开新创建的序列  

在搜索提示对话框中改进了当执行蛋白质搜索时如何处理终止密码子的解释  

修正了添加Primer对话框有时认为没有指定模板的问题  

确保正确识别Windows版本  

修复了一个无法取消移除5’悬垂问题  

修复了编辑DNA结束后对参考的校准被关闭的问题  

修正了打开跟踪文件时可能发生的崩溃  

防止在线性化ssDNA后显示下游末端磷酸盐



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