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8款必备分子生物学软件,快来get

发布时间:2023-12-27 10:42:16人气:396


俗话说,兵欲善其事,必先利其器。学会使用一些好的软件,可以让你的科研工作达到事半功倍的效果。这边小编给大家介绍一些分子生物学常用的一些软件,主要包括引物设计、序列比对、分子克隆以及数据处理等。

1.Primer Premier 5

Premier是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针设计的软件。主要界面有序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和Motif分析窗口。

基本上目前引物设计都是基于Primer系列,在所有版本里,最好的是Primer 5,Primer 6太过智能,不便于使用。


2.Oligo

Oligo也是一款引物设计软件,功能很强,主要功能包括普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估引物对质量等。尤其可与Primer Premier配合使用,前者搜索引物,Oligo进行评价分析。


3.SnapGene 

SnapGene是一款免费查看质粒图谱,付费可查看更多用于质粒设计的工具。其作为序列可视化操作神器,可以进行多序列比对、自动引物设计、支持Gibson Assembly、直接导入Genbank序列号等,还可用于打开一代测序峰图哦!

小TIPS:SnapGene分为SnapGene和SnapGene Viewer两个版本。SnapGene是付费版本,但是可以申请三十天免费试用版。SnapGene Viewer是免费版本

SnapGene.png

4.Vector NTI Advance 11.5

Vector NTI Advance 11.5 是目前整合度最高,使用最多的多功能桌面序列分析软件包,包含了一整套数据分析和管理的工具。里面的东西很多,可以查看和编辑质粒图谱、序列比对等。其和Primer Premier 5一样,是分子生物学实验室的标配。


5.DNAman

DNAman是一款高度集成化的分子生物学应用软件。几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作,包括多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。


6.DNASTAR

DNASTAR Lasergene是一款专业的DNA分析软件,用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理。包括EditSeq、MapDraw、SeqMan、GeneQuest、PrimerSelect、Megalign、Protean应用程序,具有序列的编辑、格式转换、开放阅读框的查找、引物设计、酶切作图、序列比对等强大功能。

该软件可以永久免费使用

7.Origin

Origin是一款数据分析和绘图的软件,具备统计、峰值分析和曲线拟合等分析功能,可以绘制出二维和三维图形。上手难度不算大,可以将它理解为高级版本的excel,导入数据点点鼠标就可以出图。此外Origin一般是对数据进行直接绘图,如果要进行数据处理加工可以选择SPSS先处理一下。


8.GraphPad Prism

Prism是一款科研领域广泛使用的生物统计和绘图软件。如果是刚入科研大门的小白,可以先不上手Origin、SPSS等复杂一点的工具,GraphPad Prism是最适合新手绘图的工具。可以下载压缩包,本地安装。主要用于处理和分析实验数据和图表,易于学习和使用。可以调节大小,也可以同时打开多个文件,具有灵活性和可靠性。

GraphPad Prism.png

GraphPad Prism工具.png


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