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分子克隆必备软件:snapgene简介和序列比对

发布时间:2023-12-27 10:48:45人气:404


snapgene是分子克隆必备软件,主要功能有查看质粒图谱、酶切位点、设计引物、序列比对。软件可在sanpgene官网中下载。


1. 打开snapgene就可以看到左栏图标和下方说明

左栏图标和下方说明.png

左栏标注

下栏注释


2. 鼠标轻按feature,会显示该段基因的碱基总数和翻译成氨基酸的道尔顿值,这样就可以知道这段碱基序列翻译成蛋白的大小了。

feature.png

3. 序列比对步骤

①在上方工具栏的Tools选项中点击align with other sequence(前提是已有需要对比的文件,文件后缀为.dna/ .seq/ .ab1)

序列比对步骤.png

② 弹出窗口,点击要比对的序列后,就会出现下图。可以同时选择多个文件进行比对。


③ 点击下栏中的sequence,左划进度条,可以看到导入的每个碱基与原始序列的比对结果,点击下栏中的map可以看到序列间的整体差异,一般重合的地方为红色,不重合的地方为白色。

feature上为原始序列,下为导入的需要比对的序列

序列对比.png


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