创建引物SnapGene7.0及更新版本

如何创建一个引物？  

SnapGene7.0及更高版本允许您可视化引物插入，如酶，密码子或短肽序列添加到引物。  

Option1：添加已知引物序列  

  

要创建引物，首先打开目标序列，然后单击菜单“引物→添加引物”，打开“添加引物”对话框。  

将序列粘贴或键入到Primer字段中。引物的结合位置(如果与目标序列匹配)将显示在下面的面板中。  

Option2：基于目标序列创建引物  

 

在序列上选择所需的引物结合位点。当您点击鼠标并拖动选择时，将显示所选区域的长度和预测熔链温度。  

要根据所选区域添加引物，请单击菜单“引物→添加引物”。  

指定所选链  

 

指定引物是否应该基于所选的TopStrand(5'-3')或BottomStrand(5'-3')。  

命名新的引物  

 

给引物一个名称，如果需要可以添加描述。  

修改引物(可选)  

  

点击引物序列内相应位置，对序列进行修改。  

“插入工具”将出现协助添加密码子，酶位点或者引物序列的短特征。  

手动编辑引物序列，或使用插入工具添加引物序列。  

Example：在引物5'端添加酶位点  

将光标放在引物的5'末端。  

从“酶位点”下拉列表中选择一个限制性酶切位点。  

选择是否添加上游碱基，以确保适当的熔链。  

单击“插入”，将位点添加到引物中。  

任何添加都将以红色显示。  

新的限制性酶切位点将用绿线标注。将鼠标悬停在该位点上以查看酶的名称。  

显示了引物的信息，包括长度、检测到的结合位点数量、退火碱基数量和重新计算的Tm。  

新的引物扩展及其与目标(如果有的话)的预测相互作用将显示在下面的面板中。  

单击AddPrimertotemplate将引物添加到目标序列中。  

查看引物  

新的引物将显示在目标序列上。  

将鼠标悬停在引物上，可以看到显示引物详细信息的工具提示。  

单击Save保存目标序列和新的引物。

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