conda安装及使用：技术详解

conda-最方便快捷的软件下载器，没有之一。它的作用就相当于App store，90%以上的软件都能搜到，一键安装。

安装最新版Anaconda

获取Anaconda 

访问 Anaconda官网，找到Linux版本的下载链接（通常是.sh文件）。

sh是脚本（就是一个程序，后台的代码）文件的后缀，也就是说其实这是一个下载的脚本，如果你安装失败了，这个脚本是不需要重新下载的，还是可以用的。

也可以直接在bash中输入以下命令获取最新版：

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-<版本号>-Linux-x86_64.sh

注：替换<版本号>为最新版本号

运行安装脚本 

赋予脚本执行权限：

chmod +x Anaconda3-*.sh

执行安装：

bash Anaconda3-*.sh

验证安装 

完成安装后，可通过以下方法验证是否成功安装

检查conda版本：

conda --version

若安装成功，输出类似：

conda 24.5.0。

列出已安装包：

conda list

配置conda镜像 

安装软件需要配置镜像： 所谓镜像网站，相当于主网站的副本，conda在国外，我们在国内下载软件速度会很慢，从镜像网站下载，可以加快下载速度。

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

使用conda 

以blast的安装为例

执行以下命令进行安装

conda install blast

查看安装是否在成功及使用方法

blastn/blastp/blastx/tblastn/tblastx -h

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