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常见问题

用Graphpad完成单因素方差分析,并绘图

发布时间:2023-03-24 16:26:48人气:4959

介   绍

今天,我们就以动物行为学数据进行一下示范,因为影响因素只有药物,所以我们应该使用单因素方差进行分析的方法。

我们回顾一下进行单因素方差分析的基本步骤:

a. 对各个组数据进行正态性检验;b. 对各个组数据进行方差齐性检验;c. 进行各个组之间均值的比较(单因素方差分析)。


软    件

GraphPad Prism 8: (version 6或7,8均可),操作步骤类似,在这里我们用GraphPad Prism 8进行展示。

用Graphpad完成单因素方差分析.png

GraphPad Prism软件名称


1. 下面是我们的数据,我们首先进行数据的统计描述

数据图.png

2. 首先打开Graphpad软件,输入数据,更改组名,更改Data1为Total distance

,更改组名,更改Data1为Total distance.png

软件打开数据.png

3. 进行数据正态性检验:选中数据 – Analyze - Column analyses - Normality and Log normality Tests -选中组别-OK

5.png

4. 进行正态性检验软件参数设置

6.png

5. 查看结果,因为选中了四种统计方法,所以出现了四种统计结果来进行高斯分布的描述,我们只看一种就可以了。四种方法均显示, Passed normality test (alpha=0.05), P value summary为ns。因此,可以进行单因素方差分析了。

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6. 选中数据,进行单因素方差分析

8.png

7. 这里呢,我们首先假设方差相等

9.png

8. 设定需要比较的组,或者两两比较也行

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9. 方差如果相等的话就可以直接看结果了,但是方差不等,如下所示,那么我们应该假设方差不等。

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10. 我们应该选择方差不等,使用Brown-Forsythe and Welch ANOVA tests。

12.png

13.png

11. 然后查看结果,看看之间的比较是否具有显著性差异。这里显示出了Significant,星号,P值等。

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12. 作图,选择图形,Column,Mean/meadian&error,我们来做个基本的柱状图

15.png

13. 调色,改变标签。(不会的请看Graphpad做小提琴图和箱线图等)。

16.png

14. 进行显著性标记,模型组和空白组我们使用#表示,模型组和给药组我们用*表示,进行标记。

17.png

15. 保存Graphpad文件,保存TIFF图片,300dpi。

18.png

以上是Graphpad完成单因素方差分析,并绘图教程。

是不是很简单?赶紧来试试吧~


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