用Graphpad完成单因素方差分析，并绘图

介   绍

今天，我们就以动物行为学数据进行一下示范，因为影响因素只有药物，所以我们应该使用单因素方差进行分析的方法。

我们回顾一下进行单因素方差分析的基本步骤：

a. 对各个组数据进行正态性检验；b. 对各个组数据进行方差齐性检验；c. 进行各个组之间均值的比较（单因素方差分析）。

软    件

GraphPad Prism 8： (version 6或7，8均可），操作步骤类似，在这里我们用GraphPad Prism 8进行展示。

GraphPad Prism软件名称

1. 下面是我们的数据，我们首先进行数据的统计描述

2. 首先打开Graphpad软件，输入数据，更改组名，更改Data1为Total distance

3. 进行数据正态性检验：选中数据 – Analyze - Column analyses - Normality and Log normality Tests -选中组别-OK

4. 进行正态性检验软件参数设置

5. 查看结果，因为选中了四种统计方法，所以出现了四种统计结果来进行高斯分布的描述，我们只看一种就可以了。四种方法均显示, Passed normality test (alpha=0.05), P value summary为ns。因此，可以进行单因素方差分析了。

6. 选中数据，进行单因素方差分析

7. 这里呢，我们首先假设方差相等

8. 设定需要比较的组，或者两两比较也行

9. 方差如果相等的话就可以直接看结果了，但是方差不等，如下所示，那么我们应该假设方差不等。

10. 我们应该选择方差不等，使用Brown-Forsythe and Welch ANOVA tests。

11. 然后查看结果，看看之间的比较是否具有显著性差异。这里显示出了Significant，星号，P值等。

12. 作图，选择图形，Column，Mean/meadian&error，我们来做个基本的柱状图

13. 调色，改变标签。（不会的请看Graphpad做小提琴图和箱线图等）。

14. 进行显著性标记，模型组和空白组我们使用#表示，模型组和给药组我们用*表示，进行标记。

15. 保存Graphpad文件，保存TIFF图片，300dpi。

以上是Graphpad完成单因素方差分析，并绘图教程。

是不是很简单？赶紧来试试吧~

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